女性生殖道有两道天然防线，一道是“解剖防线”，由外至内有五道关卡，女士洁阴的范围往往涉及第一、第二道关卡。第一道关卡在外阴部，两侧大阴唇自然合拢，遮掩阴道口，使细茵难以进入。第二道关卡在阴道，由于骨盆底肌肉的作用，使阴道前后壁紧贴，阴道口闭合，可防止外界的污染。若为经产妇，产后阴道松弛，防御功能有所削弱。另一道是“生理防线”。一方面，在雌激素的影响下，阴道上皮细胞不断新陈代谢、增生变厚，增加了对病原体的抵御力。另一方面，在阴道杆菌的作用下，阴道上皮细胞中富含的糖原可分解为乳酸，以维持阴道正常的酸性环境，使适应于弱碱环境中繁殖的病原体受到抑制，这在医学上称为阴道的自净作用。所以说，健康妇女的阴道内虽有一些细菌存在，但通常不引起炎症。
引起女性生殖道炎症的病原体不外乎两大来源，即来自原本寄生于阴道内的菌群，或来自外界入侵的病原体。正常情况下，阴道内以阴道杆菌占优势，还有少量厌氧菌、支原体及念珠茵，这些茵群形成一种正常的生态平衡。但是，当人体免疫力低下、内分泌激素发生变化，或外来因素如组织损伤、性交，破坏了阴道的生态平衡时，这些常住的菌群会变成致病菌，冲破阴道屏障而引起感染。
