多囊卵巢综合征也是一种常见的排卵异常。其病因比较复杂，至今仍是医学界研究的热点。临床表现形式也多种多样。除了不排卵导致闭经或月经不调外，还可能出现多毛、肥胖、痤疮等体征。其卵巢的特点是巢体积增大，有多个小卵泡但却不能发育成熟，因此需要用药物来促卵泡发育诱发排卵。
垂体问题导致排卵异常的常见疾病有高泌乳素血症、垂体泌乳素瘤和希罕氏综合征等。高催乳素水平可抑制排卵。如果激素测定显示泌乳素增高，首先要根据泌乳素增高的程度做进一步检查，弄清有无垂体泌乳素瘤，如果因垂体瘤引起闭经泌乳，则应根据瘤体大小决定是否手术或药物治疗。
高泌乳素血症的患者经治疗后，泌乳素可降至正常，排卵恢复，妊娠率很高，但应在医生的指导下用药。希罕氏综合征是指由于产后大出血引起的垂体前叶缺血或栓塞造成缺血性坏死，垂体功能低下，导致排卵障碍，同时伴有甲状腺和肾上腺等多个内分泌腺体的功能低下。治疗这类排卵障碍的有效方法是应用促性腺激素诱导排卵。
下丘脑功能障碍导致不排卵是由于下丘脑的输入信号不正常而导致促性腺激素释放激素减少。包括紧张、精神性厌食、单纯体重下降性闭经和运动量过大导致闭经等。盼子心切、精神紧张也可导致内分泌的障碍;全身严重的消耗性疾病或营养不良也可致无排卵和闭经。
这一类排卵障碍的治疗涉及精神治疗和生活方式的调整，使其恢复下丘脑-垂体-卵巢的功能。因其低性腺激素的特点，所以对要求生育者可应用促性腺激素治疗来诱发排卵。
